foto: iStockphoto.com

I váš počítač může najít lék na koronavirus, stačí být online

Věci chytřetéma 5 min čtení

Pomozte vědcům se složitými výpočty při hledání nových léků a vakcín. V minulosti už takto celý svět hledal mimozemské civilizace, nyní se semkl v boji proti pandemii COVID-19.

Líbí se vám článek? Sdílejte ho:

Pomozte vědcům se složitými výpočty při hledání nových léků a vakcín. V minulosti už takto celý svět hledal mimozemské civilizace, nyní se semkl v boji proti pandemii COVID-19.

Související článek

Ostravští vědci do boje proti koronaviru nasazují superpočítače

Národní superpočítačové centrum při VŠB-Technické univerzitě Ostrava IT4Innovations nabídlo výzkumným týmům v boji proti šíření nového koronaviru možnost využít přednostní přístup k výpočetnímu času superpočítačů Anselm, Salomon a Barbora. Superpočítače mohou pomoci nejen při hledání léku, ale i s vývojem roušek.

Kéž by se tak dal výkon všech počítačů na světě spojit a smysluplně využít k vědeckému bádání... Ale počkat, to už dávno není jen zbožné přání. Je to realita už desítky let. Do odborného výzkumu se dnes může zapojit každý, není nutné být vědcem. Stačí na počítači spustit jednoduchý program, který pomůže s pokročilým výzkumem v oblasti medicíny.

Od hledání ufonů k boji proti nemocem

Projekty, které na dálku využívají sílu výpočetního výkonu procesorů počítače nebo čipů grafických karet, spoléhají na tzv. distribuované výpočty. V rámci nich má každý počítač na starost vyřešení části úlohy nějakého složitějšího výpočtu. Tím, že se úloha rozdělí mezi více počítačů, probíhá její řešení rychleji.

Související článek

Když se lidé semknou. Jak vypadá boj proti koronaviru v digitální éře?

Odborníci na IT sice bojují s viry často, většinou se ale jedná o ty počítačové. Teď se část digitální komunity pustila do bitvy proti koronaviru. A protože moderní technologie dokážou v dnešním světě opravdu hodně, jsou první výsledky velmi zajímavé.

První projekty se rozběhly v 90. letech, v roce 1999 byl spuštěn populární program SETI@home. Měl dva cíle. Tím prvním bylo testování a vylepšování technologie distribuovaných výpočtů. Druhým a mnohem zajímavějším cílem bylo hledání stop inteligentního života mimo naši planetu. Jedním ze způsobů pátrání byla analýza mimozemských rádiových signálů, které zachytily pozemské teleskopy. V reálu tak zapojené počítače analyzovaly vzorky šumu z vesmíru. V případě objevení rádiového signálu, který vznikl úmyslně, by šlo o důkaz existence mimozemské technologie.

První cíl SETI byl splněn, když vznikl otevřený software – platforma BOINC, kde je možné spouštět projekty s distribuovanými výpočty. Potvrzení, že nejsme ve vesmíru sami, jsme se však zatím nedočkali, ale doufat můžeme nadále. Za 21 let fungování se totiž nasbíralo ohromné množství zpracovaných dat, která je nutné dále analyzovat.

Průběh zpracování úkolů Folding@home -

Projekt SETI@home byl letos na konci března dočasně pozastaven a plynule přešel pod zastřešující Folding@home, který se v současné době zaměřuje na boj s koronavirem. Program funguje pod záštitou Stanfordské univerzity a představuje cennou pomoc při výzkumech různého zaměření. Komunita uživatelů na svých počítačích analyzuje data pro výzkum nádorových onemocnění nebo třeba Parkinsonovy a Alzheimerovy choroby. Díky získaným výsledkům se mohou vyvíjet léky, vakcíny a jiné podpůrné prostředky. Za efektivitu výsledků hovoří například 223 publikovaných vědeckých prací k březnu 2020, výzkum se díky Folding@home urychlil až 100násobně, což se může hodit třeba pro boj s aktuální pandemií.

Megavýkon na počítání

Do projektů se společným počítáním se mohou zapojit jednotliví dobrovolníci, ale také celé instituce, univerzity, datacentra firem apod. V době karantény se například do projektu Folding@home zapojily nevyužité počítače učeben Masarykovy univerzity v Brně, Západočeské univerzity v Plzni a dalších.

Do projektů distribuovaných výpočtů se zapojily počítače českých univerzit -

K distribuovaným výpočtům se může připojit kdokoliv, kdo má přístup k internetu a může na počítač nainstalovat jednoduchý program, který prostřednictvím procesoru řeší zadanou početní úlohu. Počítače mohou na výpočtech pracovat v době nečinnosti, při pracovní přestávce nebo po zapnutí spořiče obrazovky. Samozřejmě to jde i na pozadí během běžného využívání stroje. Je dobré mít ale na paměti, že vytížení procesoru ubírá výkon celému počítači. Pokud by procesor nestíhal, aplikace počítání vypíná a opět ho zase zapne, jakmile to je možné.

Související článek

Zájem o Teams vzrostl kvůli koronaviru asi sedmkrát, říká Eduard Filek z T-Mobile

Zájem o nástroje pro videokonference a online spolupráci stoupl ze dne na den sedminásobně. Firmy se teď bez nich neobejdou a zůstane to tak i do budoucna. Zatím však často narážejí na nedostatečnou kvalitu připojení a špatné vybavení domácích kanceláří.

O popularitě Folding@home hovoří zveřejněné údaje k 30. březnu 2020 – aplikace pro počítače dosáhla již jednoho milionu instalací. V polovině března na platformě taky běželo 23 výzkumných projektů v souvislosti s koronavirem.

Složité se mění v jednoduché

V případě boje proti COVID-19 se výpočty používají na vytváření simulací složek viru, zkoumá se chování jeho proteinů o velikosti makromolekul a obecně princip jeho fungování. Díky tomu půjde nalézt účinný lék a vakcínu. Vzhled a činnost proteinových struktur je nutné modelovat ve spoustě variant, aby šlo nalézt vhodnou obranu v každém okamžiku působení na lidský organismus. K tomuto složitému početnímu úkolu se náramně hodí kumulovaný výkon zapojených počítačů Folding@home i podobného projektu Rosetta@home.

V rozhraní klienta Folding@home si můžete vybrat typ projektu, na který chce nasadit početní výkon (COVID-19, rakovina, Alzheimer...). Případně ponechte volbu „Any disease“ a nechte to náhodě. Uživatelé se mohou spojovat do týmů, pro Českou republiku již jeden oficiální funguje, aktuálně má bezmála 1 500 účastníků.

Průběh počítání zadané úlohy -

Dalším z projektů distribuovaných výpočtů je Rosetta@home na platformě BOINC, patřící pod univerzitu v Berkeley. Stačí instalovat BOINC manager a zvolit projekt k počítání. Oficiálně se přidala PEF ČVUT, vy se můžete přidat například k týmu Netbox.

Témata:
Líbí se vám článek? Sdílejte ho:
link odkaz
Reklama